‌ماده 4 - میزان 70% از مجموع درآمدهای وصولی به شرح فوق که به حساب درآمد عمومی کشور منظور می‌شود حداکثر تا سقف 1.000.000.000 ریال به‌عنوان اعتبار هزینه‌های تحقیقاتی از محل اعتبار ردیف 144002 قسمت چهارم قانون بودجه سال 1368 در اختیار سازمان انرژی اتمی ایران قرار خواهد گرفت‌که بر اساس موافقت‌نامه‌هایی که با وزارت برنامه و بودجه مبادله می‌شود به مصرف برسد.

‌ماده 5 - 100% اعتبار هزینه‌های تحقیقاتی مذکور مطابق ماده یک آیین‌نامه نحوه مصرف اعتبارات تحقیقاتی موضوع تبصره 16 قانون متمم قانون بودجه سال1361 که در جلسه مورخ 1365.8.28 هیأت محترم وزیران به تصویب رسیده از شمول قانون محاسبات عمومی کشور مستثنی بوده و مصرف آن تابع قانون‌نحوه هزینه کردن اعتبارات خارج از شمول قانون محاسبات عمومی و این آیین‌نامه خواهد بود.

‌ماده 6 - سازمان می‌تواند بنا به ضرورت جهت انجام خدمات فنی و آزمایشگاهی مربوطه قسمتی از اعتبار هزینه‌های تحقیقاتی موضوع این آیین‌نامه را در اختیار‌مؤسسات تابعه قرار دهد. لکن در هر حال در مصرف آن باید مفاد ماده 5 این آیین‌نامه رعایت شود.

‌ماده 7 - در مصرف اعتبار مذکور از نظر انواع هزینه‌ها و مبادله موافقت‌نامه مربوط باید حدود زیر رعایت شود. ‌الف - هزینه‌های پرسنلی و اداری حداکثر 60% ب - هزینه‌های سرمایه‌ای حداقل 40% ‌تبصره 1 - خرید و احداث ساختمانهای اداری و غیر آزمایشگاهی از محل اعتبار مذکور مجاز نمی‌باشد. ‌تبصره 2 - میزان پرداخت حق‌التحقیق بر اساس آیین‌نامه تبصره 16 قانون متمم قانون بودجه سال 1361 موضوع تصویب‌نامه شماره 64032 مورخ1365.9.20 خواهد بود.

‌ماده 8 - رییس سازمان مکلف است گزارش عملکرد درآمدهای موضوع این آیین‌نامه و هزینه‌های تحقیقاتی را در پایان هر چهار ماه از ابتدای سال مالی از طریق‌وزارت برنامه و بودجه برای اطلاع کمیسیون برنامه و بودجه و سایر کمیسیونهای مربوط مجلس شورای اسلامی ارسال نماید.

‌ماده 9 - حقوقی که در اثر اجرای طرحها و فعالیتهای مختلف موضوع این آیین‌نامه تحصیل شود کلاً متعلق به سازمان این اتمی ایران خواهد بود. ‌میرحسین موسوی - نخست‌وزیر